Detalhe da pesquisa
1.
An antibiotic from an uncultured bacterium binds to an immutable target.
Cell
; 186(19): 4059-4073.e27, 2023 09 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37611581
2.
Teixobactin kills bacteria by a two-pronged attack on the cell envelope.
Nature
; 608(7922): 390-396, 2022 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35922513
3.
DeepRank-GNN: a graph neural network framework to learn patterns in protein-protein interfaces.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36420989
4.
Discriminating physiological from non-physiological interfaces in structures of protein complexes: A community-wide study.
Proteomics
; 23(17): e2200323, 2023 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37365936
5.
Improving the quality of co-evolution intermolecular contact prediction with DisVis.
Proteins
; 91(10): 1407-1416, 2023 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37237441
6.
Impact of AlphaFold on structure prediction of protein complexes: The CASP15-CAPRI experiment.
Proteins
; 91(12): 1658-1683, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37905971
7.
Integrating quantitative proteomics with accurate genome profiling of transcription factors by greenCUT&RUN.
Nucleic Acids Res
; 49(9): e49, 2021 05 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33524153
8.
Computational approaches to therapeutic antibody design: established methods and emerging trends.
Brief Bioinform
; 21(5): 1549-1567, 2020 09 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31626279
9.
PDB-tools web: A user-friendly interface for the manipulation of PDB files.
Proteins
; 89(3): 330-335, 2021 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33111403
10.
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment.
Proteins
; 89(12): 1800-1823, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34453465
11.
LightDock goes information-driven.
Bioinformatics
; 36(3): 950-952, 2020 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31418773
12.
iScore: a novel graph kernel-based function for scoring protein-protein docking models.
Bioinformatics
; 36(1): 112-121, 2020 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31199455
13.
proABC-2: PRediction of AntiBody contacts v2 and its application to information-driven docking.
Bioinformatics
; 36(20): 5107-5108, 2020 12 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32683441
14.
Shape-Restrained Modeling of Protein-Small-Molecule Complexes with High Ambiguity Driven DOCKing.
J Chem Inf Model
; 61(9): 4807-4818, 2021 09 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34436890
15.
Pre- and post-docking sampling of conformational changes using ClustENM and HADDOCK for protein-protein and protein-DNA systems.
Proteins
; 88(2): 292-306, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31441121
16.
The structural details of the interaction of single-stranded DNA binding protein hSSB2 (NABP1/OBFC2A) with UV-damaged DNA.
Proteins
; 88(2): 319-326, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31443132
17.
An overview of data-driven HADDOCK strategies in CAPRI rounds 38-45.
Proteins
; 88(8): 1029-1036, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31886559
18.
M3: an integrative framework for structure determination of molecular machines.
Nat Methods
; 14(9): 897-902, 2017 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28805795
19.
Large-scale prediction of binding affinity in protein-small ligand complexes: the PRODIGY-LIG web server.
Bioinformatics
; 35(9): 1585-1587, 2019 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31051038
20.
Coupling enhanced sampling of the apo-receptor with template-based ligand conformers selection: performance in pose prediction in the D3R Grand Challenge 4.
J Comput Aided Mol Des
; 34(2): 149-162, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31720895